Yksi Unioninkadun Messiaiden kiistämättömistä päälajeista on jalkapallo, jossa seuralla on aina alkuhetkiin asti ulottuvat perinteet. Vaikka joukkue on kärsinyt viime kausina pelillisestä lamasta, joukkueen progressiivinen, postmoderni, jopa dadaistinen pelityyli on saanut vastustajien suupielet ainakin hymyyn.

Jalkapallon asema Messiaissa on turvattu, sillä lajilla on vankka kannattajapohja. Vaikka joukkueessa ei ole kovan linjan futisfundamentalisteja, pelikokemusta osalla pelaajista on todistetusti ainakin miesten Kolmosesta. Ja se on yliopistosarjoissa jotain se.

Otaniemeläisen informaatioverkostojen kilta Athenen jalkapallojoukkue Ethanaa vastaan Messiaat onnistui kesällä 2005 nappaamaan komean 6-3-voiton. Voitto katkaisi joukkueen tappiokierteen ja puristi tuubista balsamia Messiaiden syviin viiltohaavoihin.

Vuonna 2006 Messiaiden jalkapallojaoston tavoitteena on päästä yliopistosarjan alkulohkoista jatkopeleihin.